Ang Mutya ng Section E ay sumusunod sa paglalakbay ni Mutya, isang matalino at masigasig na kabataang babae mula sa Section E, isang klase na madalas hindi binibigyang pansin ng iba. Sa kabila ng mga pagsubok at mga inaasahang inilalagay sa kanya, ipinapakita ni Mutya ang kanyang katalinuhan, katatagan, at determinasyon upang magtagumpay hindi lamang sa akademiko kundi pati na rin sa kanyang personal na paglago at mga relasyon. Habang tinatahak niya ang buhay ng isang mag-aaral sa hayskul, nakakaranas siya ng mga isyu tulad ng pagkakaibigan, problema sa pamilya, pagdududa sa sarili, unang pag-ibig, at ang tensyon ng pagiging totoo sa sarili at pagsunod sa mga inaasahan ng iba.