Когато един извънземен организъм, известен като "Savage" атаки човечеството, единствената технология, способна да борбата врага е оръжие, известно като "Сто." А оцелял от Savage атака, Hayato Kisaragi е тийнейджър може да се похвали с най-високо ниво на съвместимост с посочените по-горе технология и като резултат, е поканен да овладеят уменията си в Little Garden, престижна военна академия на борда на кораб.

В течение на интензивен си обучение за предстояща битка, той веднага привлича интереса на множество женски връстници и получава въвлечена в редица инциденти, както той се опитва да се бори срещу същества, които сега населяват Земята и заплашват неговата безопасност.